Gene und Stammb�ume: Ein Handbuch zur molekularen Phylogenetik

Gene und Stammb�ume: Ein Handbuch zur molekularen Phylogenetik

by Volker Knoop, Kai Mïller

Paperback(2. Aufl. 2009)

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Overview

Gene, Genome und Sequenzen auf der einen Seite, Algorithmen, Computer und Informatik auf der anderen - sie üben Faszination aus, halten aber viele Interessierte auf respektvolle Distanz. Die Schnittstelle der Bereiche ist mit dem modernen Begriff Bioinformatik belegt. In der Tat hat die Synthese von zwei unabhängigen Disziplinen selten so viele faszinierende neue Einsichten geliefert.

Eine spannende Teildisziplin der Bioinformatik ist die Molekulare Phylogenetik, deren Ziel die Rekonstruktion von Stammbäumen aus molekularen Daten ist: Computer, moderne Molekularbiologie und Kladistik haben der etwas angestaubten biologischen Systematik und Taxonomie eine ungeahnte Renaissance verschafft. Der Einstieg in beide Welten gleichzeitig - Molekularbiologie und Phylogenetik - war nicht unbedingt einfach. Hier schloss „Gene und Stammbäume" 2006 eine Lücke. Die zweite Auflage behält das bewährte Konzept bei, ist aber inhaltlich um zwei Kapitel erweitert, die den neuesten Trends unter anderem bei Bayesianischen Ansätzen Rechnung tragen.

Einführende Kapitel über Molekularbiologie, Evolution, Taxonomie und Kladistik ermöglichen je nach Wissenshintergrund einen leichten Zugang zur Molekularen Phylogenetik. Den besonders schnellen Einstieg erlaubt ein spezielles Kapitel über den Weg von der Sequenz zum Stammbaum ohne Umwege oder Details. Wer es genauer wissen will, bekommt detaillierte Einführungen in die wichtigen methodischen Ansätze: Parsimonie, Distanzverfahren, Maximum Likelihood und Bayesianische Verfahren. Speziellere Kapitel widmen sich neuen Methoden für stammbaumbasierte statistische Tests, Supertrees, Analysen von Substitutionsraten, molekularer Datierung und vielem mehr. Alles wird hands on anhand von nachvollziehbaren Beispielen mit der gängigen Software besprochen, die aus dem Internet bezogen werden kann.

Das Buch bietet so eine ideale Balance zwischen Theorie und Praxis. Es hat zahlreiche Illustrationen, bietet am Ende der Kapitel Hinweise zum Weiterlesen und schließt mit einem Glossar und einem umfangreichen Index.

Product Details

ISBN-13: 9783827419835
Publisher: Spektrum Akademischer Verlag
Publication date: 11/26/2008
Edition description: 2. Aufl. 2009
Pages: 386
Product dimensions: 6.70(w) x 9.70(h) x 1.10(d)

About the Author

Prof. Dr. Volker Knoop (geb. 1963) hat in Berlin Biochemie studiert und dort am Institut für Genbiologische Forschung und später an der Universität Ulm gearbeitet. Er ist seit 2002 Leiter der Abteilung Molekulare Evolution an der Universität Bonn und Gründungsdirektor des dortigen IZMB, des Instituts für zelluläre und molekulare Botanik.

Dr. Kai Müller (geb. 1975) ist wissenschaftlicher Assistent am Nees-Institut für Biodiversität der Pflanzen der Universität Bonn und leitet dort die Arbeitsgruppe „Systematik und Evolution". Zu seinen Forschungsschwerpunkten gehören Phylogenie und Systematik verschiedener Blütenpflanzengruppen, die Evolution von Chloroplasten-Genomen, sowie die Entwicklung bioinformatischer Methoden und Software.

Table of Contents

1 Die Molekularen Grundlagen des Lebens; - 2 Evolution, Taxonomie und Phylogenetik; - 3 Datenbanken, Sequenzen, Alignments; -4 Ein schneller Weg zum Stammbaum; - 5 Parsimonieanalyse; - 6 Distanzverfahren; - 7 Maximum Likelihood; - 8 Bayesianische Statistik; - 9 Hypothesen testen, Modellauswahl, und Methodenvergleich; - 10 Substitutionsraten und Molekulare Uhren; - 11 Genfamilien, Supertrees, Netzwerke; - 12 Molekulare Phylogenetik aktuell: neue Erkenntnisse und offene Fragen

What People are Saying About This

From the Publisher

Das einzige deutschsprachige Lehrbuch, das den Themenbereich adäquat abdeckt. Prof. Dr. Michael Melkonian, Universität zu Köln

Stimmen zur ersten Auflage:

Ein hervorragend zusammengestelltes und brandaktuelles Lehrbuch. Ein "Muss" für alle Lehrenden und Studierenden der Bereiche Evolution, Phylogenie und Systematik. Prof. Dr. Torsten Rossmann, TU Darmstadt

Dieses Buch stellt ein "Muss" dar für alle phylogenetisch Forschenden und Interessierten. Prof. Dr. Vera Hemleben, Universität Tübingen

Schließt eine wichtige Lücke im deutschen Sprachraum. Prof. Dr. Michael Melkonian, Universität zu Köln

"Gene und Stammbäume" bietet eine sehr gute Schnittstelle zwischen dem biologischen Grundstudium und der angewandten Informatik. PD Dr. Frank Hartung, Universität Karlsruhe

Methodik wird hervorragend im Überblick zusammengefasst. Aktuell. Prof. Dr. Barbara Neuffer, Universität Osnabrück

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